Πριν αναλάβει την τεχνική ηγεσία της Πόρτο, ο Φραντζέσκο Φαριόλι ήθελε να αποκτήσει τον Γιώργο Βαγιαννίδη στον Άγιαξ αλλά αργότερα υπέγραψε με τη Σπόρτινγκ Λισαβόνας.
Ο 24χρονος δεξιός μπακ άφησε τον Παναθηναϊκό για να ενταχθεί στο δυναμικό των πρωταθλητών Πορτογαλίας το περασμένο καλοκαίρι, έναντι 12 εκατομμυρίων ευρώ και να αγωνιστεί στο πλευρό του συμπατριώτη του, Φώτη Ιωαννίδη. Η Σπόρτινγκ είχε προσπαθήσει να κάνει δικό της τον Έλληνα διεθνή και τον προηγούμενο χειμώνα, ενώ την ίδια περίοδο ο Φραντζέσκο Φαριόλι που πλέον προπονεί την Πόρτο και βρίσκεται στην κορυφή της Liga Portugal, τον ήθελε στον Άγιαξ κατά τη θητεία του στην Ολλανδία σύμφωνα με την «A Bola». Το γεγονός συνέβη μόλις λίγους μήνες μετά τη φοβερή εμφάνιση του νεαρού στα προκριματικά του Europa League με αντίπαλο τον σύλλογο του Ιταλού τεχνικού και highlight την εκπληκτική «ποδιά» στον Γκοντς.
Η μετακίνηση του Βαγιαννίδη στην Eredivisie τον Ιανουάριο του 2025 δεν ολοκληρώθηκε ποτέ λόγω των χρηματικών απαιτήσεων των «πρασίνων» που ξεπερνούσαν τα 7,5 εκατομμύρια ευρώ που πρόσφερε ο «Αίαντας», όπως ακριβώς συνέβη και με την περίπτωση της Σπόρτινγκ τότε. Για την ιστορία, ο Άγιαξ έχασε στην κούρσα του τίτλου από την PSV Αϊντχόφεν ενώ από την πλευρά τους, οι Πορτογάλοι κατέκτησαν την κούπα του πρωταθλήματος στην τελευταία αγωνιστική ακόμα και χωρίς τον Ρουμπέν Αμορίμ στις τάξεις τους.
Φέτος, ο Έλληνας διεθνής ξεκίνησε ως βασική επιλογή του Ρούι Μπόρζες για τη θέση του δεξιού μπακ αλλά στα πρόσφατα παιχνίδια φαίνεται να έχει χάσει έδαφος στη μάχη με τον Φρεσνέντα, παρότι παραμένει στις επιλογές του προπονητή. Συγκεκριμένα, ο 24χρονος μοιράζεται τον χρόνο συμμετοχής στο γήπεδο με τον Φρεσνέντα καθώς ο Βαγιαννίδης έχει δώσει το παρόν σε 12 παιχνίδια (788 λεπτά) δίνοντας τρεις ασίστ, ενώ ο Ισπανός έχει αγωνιστεί σε 14 αναμετρήσεις (873 λεπτά) με απολογισμό μία ασίστ.
