Οι σχέσεις τους έχουν «κλονιστεί» αρκετές φορές. Από τα χρόνια που οι Γιουγκοσλάβοι κυριαρχούσαν σε ευρωπαϊκό επίπεδο. Το καλοκαίρι του 1988 η Εθνική ομάδα συμμετείχε στο Προολυμπιακό τουρνουά της Ολλανδίας, έχοντας τον τίτλο της πρωταθλήτριας Ευρώπης. Μετά από τη βαριά ήττα από τους Γιουγκοσλάβους, ο Παναγιώτης Γιαννάκης εξοργισμένος με τη συμπεριφορά του αείμνηστου Ντράζεν Πέτροβιτς, τον έπιασε από τον λαιμό! Ο Ντράζεν σώθηκε χάρη στην επέμβαση των πιο ψύχραιμων.
Στο Ευρωμπάσκετ του 1995, στην Αθήνα, η Γιουγκοσλαβία έχοντας τρομακτική υποστήριξη από τους διαιτητές απέκλεισαν την Ελλάδα από τον τελικό. Στον τελικό με τη Λιθουανία, οι έλληνες φίλαθλοι πήραν ανεπιφύλακτα το μέρος του Σαμπόνις και της παρέας του. Η ιαχή «Λιέτουβα, Λιέτουβα» δονούσε την ατμόσφαιρα, οι αποδοκιμασίες στα σφυρίγματα του Αμερικανού Τζορτζ Τόλιβερ και του Νίκου Πιτσίλκα (χρέωσαν με απανωτές τεχνικές ποινές τους Σαμπόνις, Μαρτσουλιόνις) επί σαράντα λεπτά έκαναν έξω φρενών τους Σέρβους, που αντέδρασαν με αποκορύφωμα μια άσεμνη χειρονομία του Σάσα Ντανίλοβιτς προς την εξέδρα. Όμοιο κλίμα και στην αναμέτρηση των δύο ομάδων στο Μουντομπάσκετ της Αθήνας (1998).
Ο αγώνας της Εθνικής με τη Σερβία, στη Γρανάδα στο Ευρωμπασκετ του 2007 μύριζε μπαρούτι. Το θρίλερ κρίθηκε υπέρ της ελληνικής ομάδας στην παράταση αλλά τα... καλύτερα τα φύλαγε για το τέλος ο Ντάρκο Μίλιτσιτς. Μετά το παιχνίδι σε ένα απίστευτο παραλήρημα, επιτέθηκε με ακατονόμαστες και χυδαίες εκφράσεις κατά των διαιτητών και εμμέσως της ελληνικής ομάδας με αποτέλεσμα να τιμωρηθεί από τη FIBA για τη συμπεριφορά του. Μέσα σ' αυτόν τον χαμό ο Γκούροβιτς έψαχνε στα αποδυτήρια τον συγχωρεμένο Φίλιππο Συρίγο γιατί, όπως έλεγε, τον είδε να χειρονομεί εναντίον των Σέρβων. Αποκορύφωμα ήταν τα θλιβερά επεισόδια προ τετραετίας στο τουρνουά «Ακρόπολις». Στη γενική σύρραξη και τις μπουνιές μεταξύ των παικτών ο Νέναντ Κρστιτς πέταξε καρέκλα στο κεφάλι του Γιάννη Μπουρούση που είχε σπεύσει να τον γλιτώσει από τον Σχορτσανίτη, αλλά του… άνοιξε το κεφάλι! Ο Έλληνας σέντερ με αίματα στο πρόσωπο, κυνήγησε τον Σέρβο που φυγαδεύτηκε στα αποδυτήρια. Για κααλή του τύχη, τον έσωσε ο Ντούσαν Ίβκοβιτς. Ο αγώνας διεκόπη, ενώ όσοι συμμετείχαν στα επεισόδια τιμωρήθηκαν από τη παγκόσμια ομοσπονδία.
