Στους 22 αγώνες που έχουν αναμετρηθεί οι δύο ομάδες στο θεσμό του Κυπέλλου οι «κίτρινοι» έχουν κερδίσει τους 8, οι «ασπρόμαυροι» τους 7 και οι υπόλοιποι 7 έχουν λήξει ισόπαλοι. Όσον αφορά τις προκρίσεις ο ΠΑΟΚ μετρά 7 (1951, 1972, 1978, 1980, 1985, 2001, 2009) έναντι 6 (1940, 1948, 1950, 1952, 1958, 1962) του Αρη.
Οι δύο ομάδες συναντήθηκαν και σε δύο τελικούς Κυπέλλου Ελλάδας. Το 1970, ο Αρης επικρατεί 1-0 με γκολ του Κεραμιδά (8') και το 2003 με ο ΠΑΟΚ πήρε τη ρεβάνς και τον τίτλο χάρη στο γκολ του Γεωργιάδη (24').
Η τελευταία συνάντηση των δύο αντιπάλων της Θεσσαλονίκης στην Τούμπα ήταν για το πρωτάθλημα στις 24 Νοεμβρίου του 2013 και ο ΠΑΟΚ ήταν ο νικητής με 3-1. Οι «κίτρινοι» προηγήθηκαν χάρη στο γκολ του Ουντότζι στο 59ο λεπτό αλλά οι γηπεδούχοι απάντησαν με τα τέρματα των Λούκας Πέρεθ (72’), Αθανασιάδη (80’) και Βούκιτς (90’).
Στις 16 Μαρτίου 2014 έγινε η πιο πρόσφατη αναμέτρηση των δύο ομάδων που έληξε ισόπαλη με 1-1 για το πρωτάθλημα με γκολ του Τάτου (23') και αυτογκόλ του Οικονομόπουλου (45').
Στην τελευταία τους μονομαχία για το Κύπελλο Ελλάδας στις 28 Ιανουαρίου 2009, ο ΠΑΟΚ κατάφερε να πάρει την πρόκριση στα πέναλτι με 8-9 σε ένα παιχνίδι-θρίλερ στο «Βικελίδης». Το ματς της Τούμπας όπως και η κανονική διάρκεια και η παράταση στην έδρα των «κιτρινόμαυρων» έληξαν ισόπαλα χωρίς τέρματα και η πλάστιγγα έγειρε προς τη μεριά του ΠΑΟΚ χάρη στην απελπιστικά άστοχη εκτέλεση πέναλτι του Καράμπελα.
Αναλυτικά η λίστα των 22 αγώνων ΠΑΟΚ – Αρης στο Κύπελλο Ελλάδας:
24/3/1940 ΠΑΟΚ - Άρης 1-1
7/4/1940 Άρης - ΠΑΟΚ 1-0
11/1/1948 ΠΑΟΚ - Άρης 2-5
19/3/1950 ΠΑΟΚ - Άρης 3-3
26/4/1950 Άρης - ΠΑΟΚ 3-1
11/2/1951 ΠΑΟΚ - Άρης 4-2
27/1/1952 Άρης - ΠΑΟΚ 1-0
6/4/1958 Άρης - ΠΑΟΚ 2-0
22/4/1962 ΠΑΟΚ - Άρης 1-1
9/5/1962 Άρης - ΠΑΟΚ 1-1*
28/6/1970 Άρης - ΠΑΟΚ 1-0
7/6/1972 Άρης - ΠΑΟΚ 1-2
17/5/1978 Άρης - ΠΑΟΚ 0-1
5/3/1980 Άρης - ΠΑΟΚ 1-0
30/4/1980 ΠΑΟΚ - Άρης 2-0
26/12/1984 ΠΑΟΚ - Άρης 2-0
16/1/1985 Άρης - ΠΑΟΚ 3-1
17/1/2001 Άρης - ΠΑΟΚ 1-1
31/1/2001 ΠΑΟΚ - Άρης 2-0
17/5/2003 ΠΑΟΚ - Άρης 1-0
14/1/2009 ΠΑΟΚ - Άρης 0-0
28/1/2009 Άρης - ΠΑΟΚ 0-0 (8-9 πεν.)
* Στο Κύπελλο της σεζόν 1961-1962 ο Αρης προκρίθηκε με κλήρωση που έγινε στα γραφεία της ΕΠΟ